Pierwszym krokiem w leczeniu nietolerancji histaminy jest zmiana diety na tzw. dietę niskohistaminową.

Następnym etapem leczenia nietolerancji histaminy obok diety niskohistaminowej jest zastosowanie suplementu z enzymem DAO.

Oprócz tego ważne jest unikać wszelkich innych wyzwalaczy histaminy, na przykład stresu, zbyt małej ilości snu czy przewlekłego stanu zapalnego w organizmie.